DNA的基本元素包括腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、鳥嘌呤（G）、胞嘧啶（C）和脫氧尿嘧啶（dU），然而目前還無法從單堿基分辨率水平上檢測dU，嚴(yán)重影響了對(duì)dU功能的理解。近期，我國科學(xué)家研發(fā)出在單堿基分辨率水平上精準(zhǔn)檢測dU的新技術(shù)，研究成果發(fā)表在《Journal of the American Chemical Society》期刊，標(biāo)題為“UdgX-Mediated Uracil Sequencing at Single-Nucleotide Resolution”。

該方法被命名為Ucaps-seq法（UdgX cross-linking and polymerase stalling sequencing）。研究人員利用從恥垢分枝桿菌中發(fā)現(xiàn)的新型糖苷酶UdgX，特異性地識(shí)別和切除DNA中的dU，形成的缺口與對(duì)應(yīng)的核糖形成共價(jià)鍵，從而將其捕獲。由于DNA高保真聚合酶碰到UdgX標(biāo)記的dU缺口能原地“停車”，研究人員利用的DNA高保真聚合酶這一特性進(jìn)一步確認(rèn)了dU的位置。最后，結(jié)合高通量測序技術(shù)將“停車”信號(hào)放大，從而在單堿基水平上精準(zhǔn)定位dU在DNA乃至基因組上的位置。

Ucaps-seq法是國際上第一個(gè)酶法檢測DNA中的dU堿基的技術(shù)，靈敏性好、特異性強(qiáng)、分辨率高，將大大推進(jìn)核酸序列檢測、遺傳密碼破譯和人類對(duì)核酸的認(rèn)知。

注：此研究成果摘自《Journal of the American Chemical Society》期刊原文章，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點(diǎn)和立場，僅供參考。

論文鏈接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.1c11269

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